Cancer: aceste 4 gene ajuta la prezicerea rezultatului
Cercetări ample privind rolul supresorului tumoral p53 oferă o mai bună înțelegere a mutațiilor genetice care se joacă în diferite forme de cancer, precum și identificarea a patru gene care pot ajuta la prezicerea perspectivei unei persoane.
TP53 gena este responsabilă pentru codificarea a ceea ce oamenii de știință numesc proteina tumorală p53 - un supresor tumoral care poate opri divizarea și proliferarea celulelor prea repede.
Cercetătorii au dublat TP53 „gardianul genomului” datorită rolului său crucial în prevenirea tumorilor și menținerea sub control a diviziunii celulare.
Cancerele umane prezintă frecvent mutații în TP53 genei, determinând eșecul unuia dintre mecanismele defensive critice împotriva cancerului.
Primele studii care au identificat TP53 mutațiile cancerelor umane au apărut în anii 1980 și, de atunci, cercetătorii au dedicat mult timp și resurse clarificării rolului său în cancer.
Acum, cel mai mare studiu de acest gen folosește probe tumorale de la peste 10.000 de pacienți cu cancer și analizează 32 de tipuri diferite de cancer pentru a înțelege mai bine rolul TP53.
Dr. Larry Donehower, profesor de virologie moleculară și microbiologie la Baylor College of Medicine din Houston, TX, a condus noua cercetare, care apare în revistă Rapoarte de celule.
Telltale 4 gene pot ajuta la prezicerea perspectivelor
Dr. Donehower și echipa au folosit cinci platforme de date diferite pentru a extrage 10.225 de probe din 32 de tipuri de cancer. Utilizând Atlasul genomului cancerului (TCGA), cercetătorii au putut evalua în mod cuprinzător rolul căii p53 în aceste 32 de tipuri de cancer.
Dr. Donehower și colegii săi au comparat apoi datele TCGA cu o altă bază de date cu 80.000 de mutații genetice pe care Dr. Thierry Soussi - profesor de biologie moleculară la Universitatea Sorbonne din Paris, Franța - le-a adunat pe o perioadă de 30 de ani.
Cercetătorii au descoperit că TP53 mutațiile au apărut mai des la persoanele care aveau o perspectivă mai slabă. Mai mult, analiza a constatat că „Mai mult de 91% din cancerele cu TP53 mutațiile arată pierderea ambelor funcționale TP53 alele ”sau variante genetice.
Dr. Donehower explică: „În unele gene de cancer, veți vedea o copie a celor două gene pierdute sau mutate”, dar „peste 91% din toate tipurile de cancer le pierd pe ambele TP53 gene, nu doar una. ”
Cea de-a doua pierdere a alelei, scriu autorii, s-a produs prin „mutație, deleție cromozomială sau pierdere copie-neutră a heterozigozității” - adică prin duplicarea genelor. Cercetătorul principal remarcă, de asemenea, că acest ultim proces a avut loc mult mai frecvent decât credeau anterior.
Foarte important, cercetarea a identificat, de asemenea, patru gene care prezentau supraexpresie la mutant TP53 tumori. Potrivit cercetătorilor, aceste patru gene pot „spune” dacă un pacient cu cancer are sau nu o perspectivă bună.
„Dacă aveți o expresie ridicată a celor patru gene, aveți un pacient care are mai multe șanse să aibă un prognostic prost [...] În schimb, dacă acel pacient are o expresie foarte scăzută a acestor gene, probabil că va supraviețui mai mult și va avea o prognostic bun. ”
Dr. Larry Donehower
„Vă va oferi o imagine mai bună a modului în care va merge decât să știți dacă este mutant TP53 sau nu ”, continuă dr. Donehower.
În cele din urmă, studiul a fost puternic asociat TP53 mutații cu instabilitate genomică, o constatare care este în concordanță cu TP53Rolul tipic de „gardian al genomului”.
Dr. Donehower comentează unicitatea noii cercetări, spunând: „Majoritatea studiilor asupra TP53 se concentreze pe un tip de cancer. ”
„Privind la 32 de tipuri diferite de cancer, vedeți că anumite tipare se mențin indiferent de tipul de cancer”.
Co-autorul studiului și directorul genomicii cancerului la Colegiul de Medicină Baylor, Dr. David Wheeler, comentează, de asemenea, despre semnificația constatărilor.
El spune: „De când TP53 este unul dintre cei mai importanți gardieni în prevenirea cancerului, cu cât înțelegem mai bine această genă, cu atât vom fi mai capabili să înțelegem biologia de bază a cancerului. Acest lucru va duce la terapii mai bune. ”
